最好的 生物信息學 為 Linux

E-Cell系統是在計算機上虛擬構造單元的概念。E-Cell系統是一個面向對象的軟件套件進行建模，仿真和大型複雜的系統，如生物細胞，經高橋耕一架構，並通過編寫一個美妙的開發團隊分析。系統，E-Cell模擬環境版本3，核心部分允許具有不同時間尺度的共存受到多個算法許多組件。電子電池項目是一個國際研究項目旨在開發必要的理論支持，技術和軟件平台，允許精確的全細胞模擬。E-Cell系統由以下三個主要部分組成： - E-Cell模擬環境（或E-Cell SE） - E-Cell模擬環境（或E-CELL ME）...

NEO（神經合奏的對象），是一個項目，提供一套通用的基類神經的數據分析中使用，以獲得OpenElectrophy，NeuroTools或許其他項目有類似目標的更緊密的目的。兩個主要的目標已經確定，到目前為止：＆NBSP; *第一個里程碑是提供一種用於處理電生理（體內和/或模擬的）數據定義通用類名和概念。＆NBSP; *第二個里程碑是重新實現這些抽象類，因為這會滿足兩個項目的模塊。該項目背後的人來討論非常開放。任何反饋是很高興的歡迎和高度讚賞 要求： ...

OpenElectrophy是一個框架，以方便操作，存儲和電生理數據進行分析。它可以從許多不同的文件格式導入數據，並將它們存儲在單個SQL型數據庫。包括OpenELectrophy分析工具振盪檢測和穗檢測。進一步的分析必須被寫入但OpenElectrophy提供類和函數的庫，它的高度有利於在數據庫和其操作有用的數據的查詢。 。提供的腳本示例的完整列表，並且可以簡單地修改，以適應任何具體數據，需要 要求： ...

tigreBrowser是從蒂格雷 - [R包結果的基因表達模式瀏覽器（http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html）。安裝：tigreBrowser需要Python版本> = 2.5。...

avalanchetoolbox是一個工具箱，用於識別和描述分支過程，如神經元雪崩 要求： ...

checkmyclones是一種軟件，它提供工具來檢查桑格測序結果＆NBSP;（或任何純文本或FASTQ文件）對一組參考序列，在任何合理的格式（包括坐標）提供 要求： ...

CWC模擬器是一個C ++實現化學武器公約，一個微積分的代表性和模擬生物系統＆NBSP的;安裝成功後（請參閱安裝），你就可以運行模擬了CWC機型，如在一些實例（見例子/）。（命令行）界面作為一個普通的用戶，你應該運行：-i model.cwc-o -t -s -n -c --qt閾值-q -w 其中： - 是可執行文件的名稱（默認：SCWC）;＆NBSP; - model.cwc是輸入CWC程序（見例子）;＆NBSP; - 統計數據是輸出文件的前綴;＆NBSP; - ...

貘是一個Python的工具，它包含程序估算並繪製系統發育信息量用於大型數據集。引用貘當使用貘，請引用： - 公元前費爾克洛思，長安Ĵ，阿爾法羅ME：貘使系統發生信息量的高通量分析。 - 湯森JP：仿形系統發育信息量。系統生物學。 2007年，56：222-231。 - 池塘SLK，弗羅斯特SDW，繆斯SV：的HyPHY：假設使用系統發育測試。生物信息學2005，21：676-679。安裝目前，安裝程序最簡單的方法是：混帳混帳克隆：//github.com/faircloth-lab/tapir.git...

橙生物信息學是一個橙色的數據挖掘軟件附加＆NBSP;它擴展橙在生物信息學的基本任務提供常用功能。它還提供了小部件橙色帆布，使用戶誰是不是程序員來管理芯片和基因組數據流量和通過結合常見的數據分析工具，以滿足他們的需求來定制他們的分析。文檔被找到在：http://orange-bioinformatics.readthedocs.org/Requirements:Python...