E-Cell System

E-Cell系統是在計算機上虛擬構造單元的概念。
E-Cell系統是一個面向對象的軟件套件進行建模，仿真和大型複雜的系統，如生物細胞，經高橋耕一架構，並通過編寫一個美妙的開發團隊分析。系統，E-Cell模擬環境版本3，核心部分允許具有不同時間尺度的共存受到多個算法許多組件。
電子電池項目是一個國際研究項目旨在開發必要的理論支持，技術和軟件平台，允許精確的全細胞模擬。
E-Cell系統由以下三個主要部分組成：
- E-Cell模擬環境（或E-Cell SE）
- E-Cell模擬環境（或E-CELL ME）
- E-Cell分析工具包

功能：

<李班=“bbli”>基本功能：
• 在面向對象的建模和仿真複雜系統。
• 插件架構。新的用戶對象類可以開發，動態加載，並在模擬中使用。

在模擬過程中
• 實時用戶交互和可視化。

<李班=“bbli”>腳本：
• 模擬會話的Python腳本（啟動/停止/參數操作/數據處理等）。
• 的模擬實驗，涉及的模擬會議多次運行Python腳本（如參數調整，代謝控制分析等）
• 在模型文件生成的Python腳本（如從數據庫中自動模型建設）。

<李班=“bbli”>兼容性：
• 在SBML水平1/2進口。
• 在SBML水平1/2的出口。

<李班=“bbli”>並行計算：
• 共享內存，單個模擬會話的多線程並行化。 （要合併到主分支。）
• 集群和網格的分佈式多模擬會話計算。 Sun Grid Engine的，（Globus的工具包）。

什麼在此版本中是新的：

• 在這個版本增加了各種錯誤修正

什麼是新的版本3.1.107 RC2：

• 修正了一個在ecell.Session.saveLoggerData錯誤（）。 （森吉）
• 修正了ecell.ECDDataFile的錯誤。 （森吉）

什麼是版本3.1.107 RC1新：

• 在固定編制的新的海灣合作委員會（GT的問題; = 4.3）。 （森吉）
• 集成到pyecs pyecell。 （森吉）
• 在合併ecell.emc到ecell.ecs，以避免在某些平台上（包括Mac OS X）靜態初始化的怪事。 （森吉）
• 在兩個GUI前端（會話監控和模型編輯器）被重新成為Python模塊，ecell.ui.osogo和ecell.ui.model_editor兩個包。 （森吉）
• 感動GtkSessionMonitor到ecell.ui.osogo.GtkSessionMonitor駐留在ecell /前端/ SESSION_MANAGER。 （森吉）
• 更名為ecell.SessionManager ecell.session_manager。 （森吉）
• 刪除從ecell.ecs_constants以下常量。 （森吉）