Staden Package

施塔登包是一個全面發展的一套DNA序列組裝（Gap4），編輯和分析工具（旋轉）為Unix，Linux和MacOSX上和MS Windows的。
在Gap4面前出現了幾次小的加入相關
改進如何得分加盟查找內部聯接和
在加入編輯器中的對齊按鈕的功能。
還後果gap4的是各種變化io_lib（該
庫所有I / O，以各種跟踪文件格式）。通過加入
新hash_exp程序現在允許實驗文件是
連接到一起，並建立索引。實驗的文件名列表
應STIL提供給gap4，但所提供的EXP_PATH環境
變量已經被正確設置gap4就能取個人
序列出級聯實驗文件
存檔。改進的用戶界面，這仍然需要
製作。
454 SFF檔案現在更好的支持。該defsult 454指數
現在的工作，雖然hash_sff程序可以被用來提供一個
另一種索引策略（可能快於某些情況下）。
Gap4和崔佛也有另外的痕跡跟踪顯示風格，
每次有電話基地1個樣品掃描（4個通道）。在這種情況下，可以
也借鑒4置信度值，而不是1元的基礎。這些能力
將能更好地整合的Solexa的痕跡時，更容易
可用。
另外，當然bug修復和小的調整通常的組合。見
完全更改日誌詳細信息（通過SourceForge的網站）。
其他顯著的變化
Gap4