SAVI Signaling Analysis and Visualization

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SAVI Signaling Analysis and Visualization
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版本: 2.5
上傳日期: 23 Sep 15
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查看的蛋白質 - 蛋白質和配體 - 蛋白質相互作用的曲線圖(網絡),其中的生物分子被表示為節點和它們之間的相互作用被表示為鏈路,是一種有前途的方法用於集成不同來源的實驗結果來實現的分子機制系統了解駕駛細胞表型。大規模的信令網絡的出現提供了一種拓撲統計分析的機會,而這種網絡的可視化提出了挑戰。 SAVI實現標準方法來計算聚類,連接分佈和檢測,以及可視化,網絡圖案。此外,SAVI產生的網絡數據集以文本格式完整的網站。 SAVI包含一個名為PathwayGenerator工具。此工具創建的連接地圖從描述細胞信號轉導的相互作用大表的網頁。 SAVI還可以從基因/蛋白名字列出網絡

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