軟件詳細信息:
全基因組表達譜提供了不同條件下的細胞的全局狀態的快照。然而,mRNA水平不提供直接的了解上游監管機制。 Expression2Kinases(X2K)是一種新的方法來確定上游監管機構可能負責在全基因組基因表達觀測到的變化。通過集成芯片起/芯片及位置重矩陣器(PWM)數據,蛋白質 - 蛋白質相互作用,並且激酶底物磷酸化反應X2K可用於識別調節機制中的基因表達的全基因組差異上游。我們的想法是第一推斷調節基因表達的差異的最可能的轉錄因子,然後使用蛋白 - 蛋白相互作用來連接使用額外的蛋白質所識別的轉錄因子構建集中於這些因素的轉錄調節子網絡,最後使用的激酶底物蛋白磷酸化反應,以確定和秩候選蛋白激酶,最有可能調節所識別的轉錄複合物的形成。 X2K還包含工具來執行基因列表富集分析和預測藥物可以逆轉或加重基因表達的變化。該X2K方法可以促進我們的細胞信號傳導的理解和解開作用機制的藥物
要求:
的Java Runtime Environment 6.0
評論沒有發現