生物信息學標杆體系是要建立一個合理的測試框架,測試和數據,以使最終用戶和廠商探討他們的系統的性能的一種嘗試。我們現在要做的是創建一個用於測試的框架,以及測試核心組都可以下載並使用探測系統性能的具體內容。此外,源頭上這些測試是根據GPL提供,並託管在Bioinformatics.org和可擴展的情報有限責任公司的想法是,以使最終用戶,消費者,系統開發商,和其他人輕鬆地構建和使用的測量和調整的原因有意義的測試。喬蘭德曼從可擴展的情報LLC構思的想法,並寫了原來的代碼。我們正在尋找更多的基準碼建議,測試,數據集等...

SciGraphica

SciGraphica 2.1.1

SciGraphica是科學數據可視化和分析應用。它提供了許多基本的繪圖功能的2D和3D圖表。它的特點打開幾個工作表和圖表在同一時間和PS輸出的工作。該libscigraphica庫是該計劃的核心,並提供所有的部件和對話框,以及新的插件系統。以下是“SciGraphica”一些主要特點:...

Staden Package

Staden Package 1.7.0 / 2.0.0 Beta 8

施塔登包是一個全面發展的一套DNA序列組裝(Gap4),編輯和分析工具(旋轉)為Unix,Linux和MacOSX上和MS Windows的。在Gap4面前出現了幾次小的加入相關改進如何得分加盟查找內部聯接和在加入編輯器中的對齊按鈕的功能。還後果gap4的是各種變化io_lib(該庫所有I /...

LayoutEditor

LayoutEditor 20110406

LayoutEditor是一個程序設計和編輯版面的MEMS /集成電路製造。設計這些佈局要求高精度。所以有足夠的分辨率和高的縮放的posibility被該電源線。該LayoutEditor的分辨率可在寬範圍內設定,通常設定為1納米計。較高的分辨率是沒有意義的,由於atomar structurs。這項決議,LayoutEditor可以借鑒的元素可達4米。這足以讓IC / MEMS延伸通常小於0.1米。 MEMS /...

AREM

AREM 1.0.1

AREM是一款基於MACS(基於模型分析的ChIP-SEQ數據)。高通量測序耦合到染色質免疫沉澱(芯片起)被廣泛用於表徵基因組範圍的轉錄因子,輔因子,染色質改性劑,和其它DNA結合蛋白結合模式。在芯片起數據分析的一個關鍵步驟是由映射高通量測序短讀取到參考基因組,並確定富含短讀取峰值區域。雖然有幾種方法已經被提出用於芯片起分析,大部分現有ACTUAL方法僅考慮讀取,可以唯一地放置在參照基因組,並因此具有低的功率,用於檢測峰值LO-重複序列內cated。在這裡,我們介紹一種概率進近的芯片起的數據分析,利用所有的...

CLHep

CLHep 2.06.08

CLHep旨在是一套HEP特異性的基礎和工具類,例如,隨機發生器,物理載體,幾何和線性代數。一些例子目錄中的文件,旨在向您展示如何使用HepMC與皮提亞。目前,它鏈接到Pythia6.1。一些平台需要作為外部這是由initpydata()調用來完成皮提亞PYDATA塊數據的初始化。如果你得到皮提亞初始化錯誤嘗試在評論/出initpydata()在MyPythia實例調用。請注意皮提亞包裝不打算成為HepMC包的一部分,他們只是提供了使實例運行 什麼在此版本中是新的: ...

GeoAlchemy

GeoAlchemy 0.7.2

GeoAlchem​​y是SQLAlchem​​y的擴展,提供了在ORM層使用SQLAlchem​​y的地理空間數據類型的支持。它的目的是支持開放地理空間聯盟(OGC)指定的空間操作和關係。安裝方式:安裝類型像往常一樣:easy_install的GeoAlchem​​y或者,下載包,變成geoalchem​​y目錄,然後鍵入:蟒蛇setup.py安裝 要求: ...