PathVisio是實現Java編程語言和設計從地上爬起來,以用於下一個GNU / Linux的操作系統顯示,分析和編輯的生物學通路的開源和完全免費的圖形應用程序,system.Can用來繪製路徑,鏈接生物entitiesThe軟件允許用戶繪製的途徑,生物實體(蛋白質或基因)鏈接到生物數據,使用數據庫標識符,編輯通路,以及分析通路。與PathVisio則還能夠映射的實驗數據,如微陣列數據和可視化它在現有通路圖的頂部。
此外,您將能夠選擇的基因數據庫,選擇一個代謝的數據庫,查看統計數據,導入表達數據,選擇表達數據集,檢索途徑,認為傳說,操作對象,引進項目,以及安裝和管理插件,它可以添加額外的功能,沒有installationThe應用程序不會對您的GNU / Linux操作系統上安裝它使用的app.Requires。所有你需要做的是從Softoware下載的二進制包,保存存檔您選擇的位置,使用歸檔管理器實用程序解壓縮,打開解壓縮目錄,雙擊pathvisio.jar file.Under的hoodWhile服用PathVisio軟件的引擎蓋下快速瀏覽一下,我們&rsquo的;已經注意到,該應用程序是完全用Java編程語言,它的圖形用戶界面的設計與最新的Java Swing技術。我們&rsquo的,已經成功通過測試的計算機支持兩種Java所在的supportedBeing用Java編程語言在任何操作系統上的32位或64位CPU architectures.Runs的應用程序,PathVisio可以宣布支持GNU / Linux的平台無關的應用程序微軟在Windows,Mac OS X,BSD,Solaris和那裡支持最新的Java技術,任何其他操作系統
什麼在此版本中是新的:
- 在2014年1月31日:Bug修復發布
- 在GeneOntology方面現在正在從搜索結果中刪除了註釋
- 的DataNodes需要與ID和數據源或沒有被註解(節電只有ID或數據源數據節點是不允許的了)
什麼是3.1.2版本,新的:
- 在固定的文件中導入模塊主要缺陷:HTTP: //developers.pathvisio.org/ticket/1697
什麼在2.0.11版本是新的:
- 在自動保存
- 在使用縮放滾輪
- 在選擇線路比較容易:不再需要點擊的確切像素
- 現在,有兩種方法過於代表性的分析; 1通路導向和一個面向數據
什麼是2.0.10版本的新:
- 在繪製新的方式圓角矩形,避免拉伸效果
- 在各種小錯誤修正
什麼在2.0.9版本新:
- 在新的連接器類型任意長度和任意的連接器角度
- 最新及QUOT;細胞成分"屬性用於存儲隔室的生物學意義
- 最新及QUOT;雙"行類型(雙層膜細胞器特別有用)
- 可點擊超鏈接
- 在看的里程碑:" milestone_27"對錯誤修復的完整列表
在通路
什麼在2.0.8版本新:
- 在改進形狀的細胞成分
- 在一些可用性方面的改進,如複製/粘貼,在彈出的菜單中
- 在看的里程碑:" milestone_26"對錯誤修復的完整列表
什麼是2.0.7版本,新的:
- 在工具欄圖標和新的側面板,使其更容易選擇箭頭類型和形狀(感謝劉冰)
- 在通路數據庫包含為數據源,這樣就可以從一個路徑添加鏈接到另一個
- 在BioPAX器進行了改進,並產生更多的有效證件BioPAX
- 在新的連接器類型,其中個別點可以被操縱(感謝leonth)
- 在數據源的數量已經增加至超過180
- 在看的里程碑:" milestone_25"對錯誤修復的完整列表
什麼是2.0.6版本,新的:
- 在錨上的形狀的數量可以增加從默認12。
- 在數據可視化的傳奇,現在可以顯示的路徑圖像本身。以前它只是在一個側板可見。
- 在看的里程碑:" milestone_24"對錯誤修復的完整列表
什麼在2.0.4版本新:
- 在改善形狀,標籤和數據節點的文本格式
- 在更多的數據節點形狀
- 在簡單的像素坐標
- 在數據節點設置背景顏色
什麼是2.0.3版本,新的:
- 在最顯著的這個版本是新的XML Schema對於GPML途徑格式(版本2010A)。這種新途徑格式將使許多新的圖形功能的未來,你可以期待其中一些出現在下一版本中。
- 在其他新功能:
- 真的看不見,至少在一些連接到他們的隱形錨(感謝瑪戈)
- 在附加-v命令行選項(感謝馬克)
- 在正確的狀態欄顯示當前選擇的數據庫再次
- 在許多新的擴展點
- 在看的里程碑:" milestone_21"對錯誤修復的完整列表
對於插件開發
什麼是2.0.1版本,新的:
- 在改進算法,指向一個錨自動連接器。
- 在具有短&QUOT箭頭類型的改進圖紙;縫隙和QUOT;在最後。
- 因為Thawte的免費信箱服務已被取消,我們更新了我們的安全證書
- 在該通路的歷史瀏覽器有每一行被認為是修正錯誤,即使它不是。這已得到修復。
要求:
- 在甲骨文的Java標準版運行環境
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