ZOOM Lite

ZOOM精簡版是新一代測序數據映射和可視化軟件。用戶輸入的參考基因組和Illumina公司/短的Solexa讀取文件或AB純色空間讀取文件的各種格式，如* .fasta，* .fastq，* _seq.txt，* .csfasta等ZOOM輸出這些短的測繪成果讀取關於參考序列。 ZOOM精簡版具有基於全新設計的多個間隔的種子理論了快速準確的映射內核。這兩個單端和配對末端不同長度的讀取15bp至240bp可以處理。允許任何數量的錯配，一個插入/刪除所讀取和參考序列的靶區域之間不同長度的。唯一映射的結果或最佳（前N個）的結果為每個讀出將根據最小錯配和插入缺失長度被報告。質量得分是用來加強測繪精度。基於映射的內核，變焦精簡版允許用戶裝載本地讀出的數據和參考序列數據中，選擇合適的參數，處理大容量數據並行多達4個CPU中，監控正在運行的任務，存儲的映射結果，查看的圖表測繪成果和輸出映射的結果要么* .BED或* .GFF文件格式的瀏覽器UCSC軌道信息進一步調查。映射的結果可以以任何期望的比例被查看，從所讀取的深度圖在整個染色體詳述序列比之間的讀取和參照序列。用戶只需輕鬆點擊，通過拖動或滾動導航到感興趣的區域。 ZOOM精簡版是ZOOM Studio軟件的衍生

什麼是此版本的新：

1.5版本包括SAM導出格式，結構調整，更好的代碼優化，小程序二進制文件的大小，並升級dabase更換發動機獲得更好的性能。