擬南芥Motif的掃描儀(AMS)是在本地計算機上運行的Windows應用程序。它的開發通過識別在模型植物擬南芥順式調節元件的位置,並通過提供一個簡單的接口,以評估基因的關係,以建立基因網絡。其主要創新特點是順式調控元件結合的位置,NGS和DNA芯片陣列表達數據,擬南芥的註釋和轉錄因子調控基因網絡的鑑定基因的相互作用。在專注於轉錄因子的功能研究,軟件使用的表達數據,並在調節基因區結合位點的圖案來預測的直接靶基因。此外,AMS利用DNA-蛋白質和proteinprotein交互數據,以促進由感興趣轉錄因子調節的代謝途徑的鑑定。
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