FlexNovo

FlexNovo 1.6.3

FlexNovo是基於所述FLEXX技術的增量構成的配位體中的活性位點的新的分子設計程序。它有利於一個片段為基礎的方法從頭設計中靶的三維結構的情況下。它意味著是一個集成的和用戶定制的理念生成系統。它表明新的結構基序,設計鉛原型庫,並且在提出新穎支架以及替代結合模式為靶蛋白。它也有利於在活性位點的深度的配位體的演變,如果一個啟動。該軟件可以是即使有專業知識結合起來,例如,考慮到與目標鍵相互作用,特定的化學基序,或某些物理化學性質更加強大。...

PoseView

PoseView 1.1.2

PoseView一個緊湊的工具,其能夠通過提供結構數據作為原始PDB文件,以產生二維圖表。該輸入可以直接來自晶體結構,或由一個對接程序計算,例如。輸出可以可視化在一GUI或出口到PNG-,PDF-或XFIG文件。...

FlexS

FlexS 2.1.2

FlexS預測相對於另一個的配位體中的一個的構象和取向。在FlexS基準配體被假設為剛性的,因此,它應該在的構象,它類似於結合狀態進行說明。在FlexS疊加算法只需要很少的人工干預。您可以通過手動進行單步整合這方面的知識到計算與FlexS。因此,FlexS設計用於配位體對,以及用於配位體為基礎的虛擬篩選的交互工作。 FlexS的兩個主要應用是配體超定位(如:為的CoMFA / QSAR)和虛擬篩選。如果你有一個蛋白和小分子結合到它(所謂的引用 -...