QuasiRecomb 1.0
QuasiRecomb是運行在命令控制台，模擬馬爾可夫模型生成病毒準種的輕量級應用程序。它描述了病毒準種和一種方法的產生，通過分析下一代測序數據來推斷其參數。模型驗證對模擬數據，示出的顯式服用重組過程考慮在內的優點，並且通過對讀取從實驗HIV樣本獲得的塗敷試驗。它提供了EM算法的實現找到模型參數，並估計病毒株在準種的分佈方法的最大後驗估計 要求：...
InDelFixer 0.9
InDelFixer是java程序刪除框移位造成插入或刪除，從下一代測序數據。在某些情況下，已知的感興趣的蛋白質具有幀偏移沒有變體。這些幀偏移可以與一個給定的參照基因組（或多個對準在以後的版本）進行校正。該程序接受標準流程克格式的文件，FASTA / PacBio CCS文件，Illumina的配對末端數據FASTQ文件 要求： Java...