CodonW

CodonW是旨在簡化密碼子和氨基酸的使用多因素分析（對應分析）的程序。它還計算密碼子使用的標準指標。它有兩個菜單和命令行界面。
該CodonW項目在保銳，遺傳學系，英國諾丁漢大學的實驗室寫由約翰·佩登。約翰是工作在人類遺傳學和目前受聘為ProCardis數據庫管理器在WTCHG在牛津大學。
這裡是“CodonW”的一些主要特點：
·用ANSI標準的C
·菜單驅動
·命令行選項廣泛號
·獨立的遺傳密碼
·上沒有限制
1.數字序列
2.序列長度
·計算的密碼子使用指數
1.蔡：密碼子適應指數
2. Fop的：優化密碼子頻率
3. NC：密碼子的有效數量
4. CBI：密碼子使用偏好指數
·計算氨基酸指數
1. GRAVY得分
2.芳香
·計算的對應分析
1.密碼子使用
2. RSCU（相對同義密碼子使用）
3.氨基酸的使用
·對應分析
1.可以包含/排除密碼子/氨基酸
2.可以生成趨勢的詳細報告
3.嘗試自動確定最佳的密碼子
4.可以允許額外的數據集被添加
5.記錄任何數量的趨勢
·計算參數基因
1基因的長度
2. GC，GC3s和密碼子位置的特定G + C
3.二核苷酸的組合物（在所有三個密碼子幀）
4.氨基酸用法
5.相對氨基酸用法
6.密碼子使用
7.相對同義密碼子使用
·在概念轉換序列的蛋白質
·重新格式化序列數據
·人力或機器可讀的輸出
·可以連接基因（同時保留閱讀框）來計算
1.整體密碼子使用
2. GC含量
3.二核苷酸組成
·生成密碼子表，氨基酸，或RSCU用法
·甚至可以幫助你學習的遺傳密碼。
·多