QuasiRecomb 1.0

QuasiRecomb是運行在命令控制台,模擬馬爾可夫模型生成病毒準種的輕量級應用程序。它描述了病毒準種和一種方法的產生,通過分析下一代測序數據來推斷其參數。模型驗證對模擬數據,示出的顯式服用重組過程考慮在內的優點,並且通過對讀取從實驗HIV樣本獲得的塗敷試驗。它提供了EM算法的實現找到模型參數,並估計病毒株在準種的分佈方法的最大後驗估計 要求:...