Arabidopsis Motif Scanner 2.0

擬南芥Motif的掃描儀（AMS）是在本地計算機上運行的Windows應用程序。它的開發通過識別在模型植物擬南芥順式調節元件的位置，並通過提供一個簡單的接口，以評估基因的關係，以建立基因網絡。其主要創新特點是順式調控元件結合的位置，NGS和DNA芯片陣列表達數據，擬南芥的註釋和轉錄因子調控基因網絡的鑑定基因的相互作用。在專注於轉錄因子的功能研究，軟件使用的表達數據，並在調節基因區結合位點的圖案來預測的直接靶基因。此外，AMS利用DNA-蛋白質和proteinprotein交互數據，以促進由感興趣轉錄因子調節...