的主軸的是基於核糖體RNA（rRNA）的基因區域的長度生物識別的另一種方法。在一般情況下，來自不同物種的初級rRNA基因序列的比對顯示核苷酸養護和變異的交替區域，無論是在核苷酸取代的術語（通常稱為“單核苷酸多態性”）和插入/缺失（INDEL）事件。的插入和缺失的結果在不同長度的序列的存在，並引入缺口的對準，通常表示為短劃線“ - ”。
我們對生物識別概念使用rRNA基因序列如下：保守區域用於定義可變片段（“主軸的高變區”），其中序列的組合長度是每個物種（一個“主軸的輪廓”）的特徵。因此，每個物種可以通過一個唯一的數字信息進行定義。
從理論上講，只有6每20個等位基因（或11個地區，每個5個等位基因）高變區的調查，就足以區分所有真核物種在地球上，這估計是5至15萬元的數目。在實踐中，主軸的是能夠與低種內變異和高親緣分辨率鑑別真核物種的93.3％。
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