SeedWaterSegmenter

SeedWaterSegmenter是一個圖形的Python工具以交互段的細胞在組織中具有邊緣的標籤的圖像堆棧＆NBSP（又名白色輪廓。）;該相互作用完全是基於種子的編輯，而這又是一個分水嶺膨脹算法。 SWS和其他工具的主要區別是，你可以把每個細胞，它可以幫助你調整難度細胞的界限多個種子。
SWS是建立在頂級的wxPython的，matplotlib，numpy的，SciPy的，和mahotas。
在它的核心，它採用了閃電般快速的分水嶺算法（感謝mahotas項目），並允許實時更新。它有一個簡單（如雜亂）UI，是完全互動的，甚至包括1級撤消。
關於SWS公佈，讓所有這些細節，更在術A部分：
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cyto.a.22034/​​abstract
源代碼被鏡像到四個倉庫和的PyPI：
- GitHub上：http://github.com/davidmashburn/SeedWaterSegmenter/
- 到位桶：http://bitbucket.org/davidmashburn/seedwatersegmenter
- Gitorious：http://gitorious.org/seedwatersegmenter
- 谷歌代碼：http://code.google.com/p/seedwater/
- PyPI中：http://pypi.python.org/pypi/SeedWaterSegmenter
在谷歌代碼頁也有一些二進制版本（http://code.google.com/p/seedwater/）應該工作在32位Windows或64位Linux的，但這些都是現在老了。現在請使用“easy_install的”方法。
有關詳細信息，請參閱Python的安裝說明20XX.txt您可能還需要閱讀的手冊：SeedWater分段V XX Manual.txt
安裝和運行
安裝終於容易！
事實上，你現在可以“easy_install的SeedWaterSegmenter”
快速說明：
Windows / Mac的：
＆NBSP;安裝Enthought Python發行http://www.enthought.com/products/edudownload.php
Ubuntu的/ Debian的：
＆NBSP;命令和apt-get安裝的python-setuptools的蟒蛇，蟒蛇wxtools-numpy的蟒蛇，蟒蛇SciPy的-matplotlib蟒蛇成像的python-xlrd蟒蛇，xlwt
在一個cmd窗口或終端（蘋果/ Linux）的（必須是在Windows Vista / 7管理員身份運行），運行：
＆NBSP; easy_install的mahotas cmpGen EllipseFitter FilenameSort GifTiffLoader ImageContour SeedWaterSegmenter
詳細說明：
最新的版本被稱為：
“Python的安裝說明八月2012.txt”
https://github.com/davidmashburn/SeedWaterSegmenter/blob/master/Python安裝說明八月2012.txt

要求：

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