Pathomx

Pathomx（原MetaPath）在IPython中，Qt和PyQt的實施一個開源的圖形化軟件，從設計來充當可視化和在GNU / Linux和其他POSIX＆NBSP代謝分析數據的交互式工具;工作系統。它最初設計用於在glanceKey處理功能代謝data.Features包括導入和導出NMR（核磁共振）的數據，光譜處理，包括標準化，分級和校準，以及代謝途徑可視化和礦業的支持。您也可以通過各種途徑進行可視化導入指定通路基因組和代謝組學數據。
各種MetaCyc數據庫註解也被包括在該Pathomx應用，其中我們可以提到數據庫統一鏈接，同義詞，以及相關的途徑和反應。請注意，MetaCyc數據庫從公共API而得。
該應用程序使用迅速地探索複雜的數據集，由於可擴展和可配置的插件，功能強大的MetaCyc數據庫。另外，它採用了numpy的和SciPy的庫數量處理，Matplotlib的圖形，nmrglue核磁共振數據導入，d3.js交互式圖表和scikit學習的統計分析methods.Under引擎蓋和支持OSesLooking的引擎蓋下Pathomx，我們可以看到該應用程序已建成IPython的命令shell。它還在Microsoft Windows和Mac OS X操作系統中，它是可供下載的預編譯的二進制包效果很好。為GNU / Linux，軟件分發只能作為gzip壓縮的源代碼文件與32位和64位硬件平台兼容。
當使用Pathomx，用戶應記住，在應用程序使用的數據來自MetaCyc途徑數據庫本身，這是BioCyc家庭的一部分。該MetaCyc API用於生成提供的數據庫，這是本地存儲

什麼在此版本中是新的：

• 一個全新的拖放可視化編輯器增加了。
• 在它允許您通過拖動工具到工作區中，通過拖放工具之間的數據線連接的編輯，並使用內嵌視圖得到當前處理的概述創建分析工作流程。
• 數據可以被丟棄到工作區即時導入。
• 這也增加了現場每個工具進度的通知，酒吧和狀態指示燈。
• 在錯誤標記有幫助文本（如果顯示在工具提示紅色）。

要求：

• 在Graphviz的