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分區是基於模型的統計軟件包確認人口細分（基因流障礙）和分配個人群體，他們的基因型的共顯性標記位點的基礎上。合適的遺傳標記包括微衛星位酶和。未鏈接，或鬆散地相連，標記基因座應使用，以便連鎖平衡的假設是合理的。
底層群體的遺傳模型適合於異交二倍體生物。它假定樣品中的個體屬於許多單獨的源種群。這些源種群被假定為處於Hardy-Weinberg平衡和連鎖平衡，但這些源種群的等位基因組成，並且在樣品中表示的源種群的連號，被視為參數，其值是未知的。
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