PANAMA是一種新型的概率模型來解釋混雜因素eQTL研究,用Python編寫的。
隱混雜因素,諸如未觀測協變量或未知細微環境擾動可以創建偽假協會或掩蓋真實遺傳關聯的信號。相較於以前的方法,巴拿馬學習隱性因素與遺傳凸顯監管機構的共同作用。其結果是,這種新的模型能夠更加準確地分辨混淆變異真實遺傳關聯的信號。
N.副食,哦。 Stegle和ND勞倫斯,“混雜因素和突出的遺傳監管機構的聯合建模提供更高的精度在遺傳基因組學研究”,公共科學圖書館計算生物學,2012
更多信息以http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.html
Requirements:
- Python
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