MultiDendrograms

MultiDendrograms是一個簡單但功能強大的應用程序，以真實數據，在開源許可下發布的＆NBSP分層聚類;從距離（或重量）矩陣開始，MultiDendrograms計算採用了最常見的凝聚層次聚類算法，其聚類允許許多圖形表示參數的調諧，其結果，可以容易地導出到文件。特點摘要：
- 多：用Java開發的，運行在所有的操作系​​統（如Windows，Linux和MacOS）。
- 圖形用戶界面：數據選擇，聚類選項，樹狀表示參數，在整個樹狀導航，偏差的措施。
- 實施分層聚類算法：變組單機聯動，聯動齊全，未加權平均，加權平均，未加權質心，加權質心與關節之間-內。
- 代表參數：大小，方向，標籤，軸等。
- 偏差的措施：同表象相關係數，歸一化均方誤差和規範化平均絕對誤差。
- 出口：超度量矩陣，文本和樹的Newick樹狀格式的詳細信息。
- 劇情：在JPG，PNG和EPS格式圖像系統樹。
MultiDendrograms實現可變組算法中，以解決在標準成對組算法和實現中發現的非唯一性問題。當不同的簇之間的兩個或多個最小距離是在合併過程中等於這個問題出現了。標準方法包括在選擇一對，打破距離之間的關係，並直到獲得最終的分層分類前進以同樣的方式。然而，不同的聚類可能取決於用來打破的關係的標準（通常是一對只是隨機選擇！）。
可變基團的算法組多於兩個簇在當關係發生的同時，產生了一種圖形表示稱為multidendrogram。其主要特性有：
- 當沒有聯繫，該可變基的算法，得到相同的結果的一對基團的。
- 他們總是給一個唯一確定的解決方案。
- 在對結果的multidendrogram表示可以在凝聚過程中明確觀察的關係的發生。此外，任何融合間隔（在程序中頻帶）的高度異質性表明相應的集群內部的程度

要求：

• 在Java 2標準版運行環境