MacMolPlt是一個化學的可視化工具,它可用於具有集成圖形模型構建器構建的分子,創建輸入文件為GAMESS計算化學程序,然後可視計算化學運行的結果。其特點包括高品質的3D顯示器,正常模式和反應序列和輸出各種格式,包括高品質的圖像和QuickTime和Flash動畫動畫。
- 在輸入使用:
- 在MolPlt文件格式衝出了GAMESS
- 通過粘貼在任何GAMESS或高斯笛卡爾坐標日誌文件
- 在任何GAMESS輸入,記錄或IRC文件
- Xmol風格XYZ文件
- 莫爾登格式的文件
- 在蛋白質數據銀行(PDB )文件
- 化學標記語言(CML)的文件
- 有一個互動的分子編輯
- 生成圖形化使用笛卡爾或Z-矩陣式的內部坐標,手工打造
- 在結構和普通模式
- 在普通模式下的動畫3D顯示。
- 3D實時旋轉和平移下鼠標控制
- 在任何Z-matrix參數的計算
- 在可視化的措施/顯示器的距離,角度和二面角。
- 線性運動最少(LLM)路徑自動創建
- 2D和3D計算和顯示:
- 在分子軌道(AO的,MO的,或LMO的)
- 在電子總密度
- 密度差異
- 分子靜電勢(MEPMaps)
- 在為GAMESS基本輸入文件生成器
- 用於高品質的3D渲染
- 支持分子對稱性
- 在生成對稱的依賴原子
- 確定對稱獨特的原子
- 自動確定一組坐標點支式組的列表。
- 在坐標旋轉到正確的方向原則
- 顯示對稱性運營商的許多點群
- 在出版質量的輸出(彩色或黑白),通過直接打印或複製並粘貼到另一個應用程序。
- 輸出的各種形式,包括Windows位圖,JPEG,PNG,CML,XMol XYZ,MDL molfile,POV-Ray的,Flash動畫和QuickTime影片。
什麼在此版本中是新的:
若干改進已到顯示的代碼。選項已被添加到prefernces的3D窗格用於平滑著色有和沒有陰影。
增加了對MOPAC文件的基本支持。
增加的選擇切換從頭開始,MM,和EFP原子的知名度。
改進的型號核心潛力的支持。
增加了一個鉤輸入建設者新GAMESSQ程序。
提高了PDB文件分析器。
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