edittag

edittag是一個應用集設計集編輯度量序列標籤，檢查序列標籤對構象到編輯度量，和整合序列標籤對特定平台的測序接頭和PCR引物。 edittag不同於其他的方法：
＆NBSP; * edittag生成編輯度量序列標籤使用多合理的時間框架任意長度
＆NBSP; * edittag產生編輯度量序列標籤集符合所選擇的編輯距離
＆NBSP; *使用edittag：引物進行整合序列標籤PCR引物
我們提供了多種大型成套編輯指標序列標籤以下格式使用edittag設計的：
＆NBSP; *文本 - 該文件是為check_levenshtien_distance.py適當的格式
＆NBSP; * csv格式
＆NBSP; * SQLite數據庫
引用
費爾克洛思BC，格倫TC。大型成套編輯度量序列識別
標籤以方便大型多路復用讀取來自大量
平行測序。 doi_
安裝：
easy_install的
easy_install的edittag
tar.gz的
wget的package.tar.gz
焦油-xzf package.tar.gz
蟒蛇setup.py安裝
知識庫
混帳混帳克隆：//github.com/baddna/edittag.git edittag
可選包（PY-萊文斯坦）
wget的http://pylevenshtein.googlecode.com/files/python-Levenshtein-0.10.1.tar.bz2
焦油-xzvf蟒蛇 - 萊文斯坦 - 0.10.1.tar.bz2
蟒蛇setup.py安裝
可選包（引物3）
如果你想設計引物結合編輯指標序列標籤，你需要首先安裝：引物的修改版本：
混帳混帳克隆：//github.com/baddna/mod-primer3.git
CD MOD-引物3 / src目錄
使
使安裝
確保您的移動MOD-引物3二進制文件到您的路徑位置（移動至少引物3，長primer3_config到您的路徑相同的目錄）。然後，您可以運行

要求：

• 在Python中
• 在NumPy的
• 在萊文斯坦
• 在MOD-引物3