BioRuby

軟件截圖:
BioRuby
軟件詳細信息:
版本: 1.5.0 更新
上傳日期: 19 Jul 15
許可: 免費
人氣: 45

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

BioRuby提供了生物信息學的集成環境(生物信息學)。
面向對象的腳本語言Ruby有許多功能,適用於生物信息學研究,例如,清楚的語法來表達複雜的對象,對於文本處理正則表達式一樣強大的Perl的大局;,各種各樣的圖書館,包括Web服務等。
由於Ruby的語法很簡單,很乾淨,我們認為這是簡單易學,適合初學者,易於使用的生物學家,也是足夠強大的軟件開發人員。
在BioRuby,開發人員可以檢索平面文件,互聯網Web服務器和本地關係型數據庫的生物資料庫的條目。
這些數據庫條目可以被解析以提取所需的信息。生物序列可以用紅寶石和rsquo的的實現的方法治療;弦樂類,並使用正則表達式。
庫可以與像BLAST,FASTA,HMMER和生物分析其他許多軟件包工具集成。
 BioRuby支持主流的生物數據庫格式,並提供了多種方法,通過平面文件索引,SQL,Web服務等多種網絡服務,包括KEGG API可以通過BioRuby很容易地利用訪問它們。

功能

  • 在BioRuby殼
  • API
  • 文檔

要求

  • 在紅寶石​​1.8.7或更高版本

類似的軟件

BigNumber.js
BigNumber.js

13 Apr 15

BPM-Widget
BPM-Widget

5 Jun 15

DendroPy
DendroPy

20 Jul 15

analyze-css
analyze-css

1 Mar 15

意見 BioRuby

評論沒有發現
添加評論
打開圖片!