CaPSID

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CaPSID
軟件詳細信息:
版本: 1.4.3
上傳日期: 20 Feb 15
開發: Shane Wilson
許可: 免費
人氣: 28

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

衣殼是一個全面的開源平台,它集成了高性能計算管道病原體序列識別 與表徵人類基因組和轉錄組以及一個可伸縮的結果數據庫,用於管理用戶友好的基於Web的軟件應用程序,查詢和可視化效果。
入門
您將需要MongoDB數據庫,一個Python 2.6+的安裝和Apache Tomcat 6+。欲了解更多詳情,請閱讀維基:

  • 在修復:http://wiki.github.com/capsid/capsid/home

    What在此版本中是新的沒有找到運行減法和調整時的錯誤消息

  • 在固定長時間運行的查詢更多的工作

什麼是1.4.2版本,新的

  • 在刪除MongoKit依賴

什麼是1.4.1版本,新的

  • 在修復光標超時長時間運行的查詢統計

什麼是1.4.0版本,新的

  • 在,而他們正在運行,而不是一切都增加統計在結束
  • 在保存的唯一ID的基因,UID

什麼在1.2.7版本新

  • 在修復README

什麼是1.2.6版本,新的

  • 在減法過濾掉映射的建築映射在讀

什麼版本1.2是新的

  • 在實用程序來創建FASTQ文件從映射的閱讀
  • 在實用程序返回FASTQ文件交叉口
  • 在實用返回過濾FASTQ文件
  • 添加mapq門檻標誌減法
  • 在Gbloader現在可以裝載細菌和真菌的基因組
  • 在保存使用GridFS的基因組序列數據庫
  • 在減少內存佔用量計算統計數據時,
  • 使用子過程,而不是使用os.system
  • 在mapq分數濾波器需要包括0

什麼是1.1版本,新的

  • 在增加了對終端的支持讀取

什麼在1.0.1版本新

  • 在添加了對MongoDB的認證支持

要求

  • 在Python中

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