擬南芥Motif的掃描儀(AMS)是在本地計算機上運行的Windows應用程序。它的開發通過識別在模型植物擬南芥順式調節元件的位置,並通過提供一個簡單的接口,以評估基因的關係,以建立基因網絡。其主要創新特點是順式調控元件結合的位置,NGS和DNA芯片陣列表達數據,擬南芥的註釋和轉錄因子調控基因網絡的鑑定基因的相互作用。在專注於轉錄因子的功能研究,軟件使用的表達數據,並在調節基因區結合位點的圖案來預測的直接靶基因。此外,AMS利用DNA-蛋白質和proteinprotein交互數據,以促進由感興趣轉錄因子調節...

Split&Join是一款專門用於生物學家的軟件,它需要以fasta,tab或fastq格式分割和連接含有大量DNA,RNA或蛋白質序列的文件。如果用戶想要分割序列,則通過將文件拖放到拖放框來加載文件。每個文件的序列數由用戶在上下數字窗口中定義。通過單擊拆分按鈕,將創建一個包含拆分文件的新文件夾。在加入的情況下,通過將序列文件拖放到拖放框中來加載序列文件。通過單擊加入按鈕,將創建一個新的加入文件。...

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Visual Blast

Visual Blast 1.4 更新

BLAST(基本本地對齊搜索工具)是一種流行的程序,用於檢索類似查詢的序列庫。 BLAST的新用戶經歷的主要問題圍繞構建語法和語義上正確的命令行,將輸入文件轉換為可接受的格式並評估輸出。在這裡,我們提供Visual BLAST圖形用戶界面來執行BLAST搜索。 Visual...