Gmatch

Gmatch 0.1.0

Gmatch是用於使用Groth的方法相匹配的目錄的工具。樣品使用 從>>>進口gmatch gmatch  >>>#負載從某處CAT1和CAT2  >>>#他們numpy的數組  >>>#N行,2列  >>> cat1.shape (20,2)  >>> cat2.shape (20,2)  >>>匹配= gmatch(CAT1,CAT2,EPS = 1E-3) ...

ANTz

ANTz 2012_04_11

ANTZ是一個互動的實時三維數據可視化軟件的複雜系統的認識。把它看成是“電子表格滿足網絡空間。”身臨其境的多維空間為基礎的環境,實時分析和決策。能夠存儲的數據與源活時間敏感的情況下結合。這是件好事尋找諺語“大海撈針”。視覺環境使得更有效的機制,以確定的模式和關係。數據字段映射到參數如幾何形狀,透明性,速度和位置。基於形狀,顏色,大小和質地的空間提示使用戶能夠識別關鍵圖案。最終的目標是關閉的用戶和被稱為計算機強大的邏輯引擎之間的認知循環...

SSuMMo

SSuMMo 0.3

SSuMMo是功能設計圍繞反复使用HMMER以序列分配到類群&NBSP庫;結果在很大程度上註明樹顯示,社區內的物種/屬分佈。包含源代碼程序,包括工具: - - 建立隱馬爾可夫模型的層次數據庫 - dictify.py; - 分配序列公認的分類名稱 - SSUMMO.py; - 分析生物多樣性,採用辛普森,香農與其他方法 - rankAbundance.py; - 可視化結果帶有明顯的能力,很容易交叉對比數據集進化樹 - comparative_results.py -...

挖洞輪車定位儀(BWA)是對齊針對長期參考序列比較短的鹼基序列,例如,人類基因組的高效程序。該軟件實現了兩個算法,BWA-短期和BWA-SW。前者作品查詢序列比200bp的短,達到約100kbp後者為更長的序列。兩種算法做跳空對齊。它們通常更精確和更快的具有低錯誤率的查詢。請參閱BWA手冊頁了解更多信息。 BWA是否對齊454讀取? 是的,沒有。 BWA的BWA-SW部分運作良好,在454讀取約200個基點以上。它實現了類似的對準精度來SSAHA2而快得多。...

poppy

poppy 0.2.8

罌粟是實現一個面向對象的系統建模物理光學與衍射傳播,特別是對於伸縮和日冕成像的多波長模擬一個Py​​thon模塊。眼下唯一的遠場衍射圖像和瞳孔平面之間(弗勞恩霍夫政權)的支持;菲涅爾傳播和中間平面是一個未來的目標。在STScI的,2010年至2012年開發的馬歇爾佩蘭,用於模擬詹姆斯·韋伯太空望遠鏡。文檔可以在網上找到http://www.stsci.edu/jwst/software/webbpsf/Requirements:Python...

模糊集阿達是一個庫,提供與操作置信因子的實現不是,與,或,異或,+和*,古典模糊集與集合論操作和可能性理論的操作,直覺模糊設置與對他們的業務,基於模糊邏輯的直覺模糊集和可能性理論;模糊數,整數和浮點與傳統的算術運算,以及語言變量和集合與他們的操作語言變量。模糊集阿達具有面向字符串的I / O支持 功能: 在信心因素與不操作,和,或,異或,+,*; 經典模糊集與集合論操作和可能性理論的操作; 直覺模糊集與他們的操作; 基於直覺模糊集和可能性理論模糊邏輯; 模糊數整數和浮點那些與傳統的算術運算;...

GeoAlchemy

GeoAlchemy 0.7.2

GeoAlchem​​y是SQLAlchem​​y的擴展,提供了在ORM層使用SQLAlchem​​y的地理空間數據類型的支持。它的目的是支持開放地理空間聯盟(OGC)指定的空間操作和關係。安裝方式:安裝類型像往常一樣:easy_install的GeoAlchem​​y或者,下載包,變成geoalchem​​y目錄,然後鍵入:蟒蛇setup.py安裝 要求: ...