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全基因組表達譜提供了不同條件下的細胞的全局狀態的快照。然而，mRNA水平不提供直接的了解上游監管機制。 Expression2Kinases（X2K）是一種新的方法來確定上游監管機構可能負責在全基因組基因表達觀測到的變化。通過集成芯片起/芯片及位置重矩陣器（PWM）數據，蛋白質 - 蛋白質相互作用，並且激酶底物磷酸化反應X2K可用於識別調節機制中的基因表達的全基因組差異上游。我們的想法是第一推斷調節基因表達的差異的最可能的轉錄因子，然後使用蛋白 -...

GATE（時間序列的表達的電網分析）是用於高維生物分子的時間序列的分析和可視化的綜合計算軟件平台。門使用基於相關的聚類算法根據分子組分的表達水平，安排分子的時間序列上的兩維六邊形陣列和動態顏色各六角形它們所分配的，以創建的系統級的分子動畫電影監管力度。以此來推斷從相關模式的潛在監管機制，GATE還允許電影對各種先驗知識數據集的互動審訊。 GATE電影可以暫停，是互動，讓用戶重建網絡，並進行功能富集分析。與GATE製作的電影可以保存在Flash格式，並直接插入到PDF文件手稿互動數字 ...

Genes2Networks是一個命令行軟件工具，可以用來放置在一個背景哺乳動物signalome和相互作用組網絡的上下文哺乳動物基因的列表。 輸入到程序是人的列表Entrez基因基因符號和SIG格式背景網絡，而所述輸出包括：用於基因/蛋白質的所有鑑定的相互作用，子網使用用於連接的基因中間部件連接的基因/蛋白質，中間組件的特異性的排名，就可以與基因/蛋白質的列表，並從種子列表的基因/蛋白質的基礎上從彼此在網絡空間中的距離的聚類分析交互 要求： 在DOS，Windows 3.X / 95/98 / ME...

研究出版物的量，每天加在考研人的知識基礎是壓倒性的。保持最新狀態與最新的研究是科學家成功的關鍵。 PubMedAlertMe可以幫助用戶隨時掌握最新與自己喜愛的考研查詢。該項目計劃運行每天或每週一次。 如果該程序的搜索引擎搜索張貼在考研最新發表的論文，它發送帶有鏈接到新的文件清單一封電子郵件，鏈接到引文導出到尾注和鏈接轉發文章同事。第2版​​增加出口引到EndNote，電子郵件文章給朋友，和固定的HTML輸出 是什麼在此版本中是新的：...

查看的蛋白質 - 蛋白質和配體 - 蛋白質相互作用的曲線圖（網絡），其中的生物分子被表示為節點和它們之間的相互作用被表示為鏈路，是一種有前途的方法用於集成不同來源的實驗結果來實現的分子機制系統了解駕駛細胞表型。大規模的信令網絡的出現提供了一種拓撲統計分析的機會，而這種網絡的可視化提出了挑戰。 SAVI實現標準方法來計算聚類，連接分佈和檢測，以及可視化，網絡圖案。此外，SAVI產生的網絡數據集以文本格式完整的網站。...