頂部 生物信息學 為 Linux

HTSeq是一個Python框架來處理和分析來自高通量測序數據（HTS）測定 要求： <...

橙生物信息學是一個橙色的數據挖掘軟件附加＆NBSP;它擴展橙在生物信息學的基本任務提供常用功能。它還提供了小部件橙色帆布，使用戶誰是不是程序員來管理芯片和基因組數據流量和通過結合常見的數據分析工具，以滿足他們的需求來定制他們的分析。文檔被找到在：http://orange-bioinformatics.readthedocs.org/Requirements:Python...

edittag是一個應用集設計集編輯度量序列標籤，檢查序列標籤對構象到編輯度量，和整合序列標籤對特定平台的測序接頭和PCR引物。 edittag不同於其他的方法：＆NBSP; * edittag生成編輯度量序列標籤使用多合理的時間框架任意長度＆NBSP; * edittag產生編輯度量序列標籤集符合所選擇的編輯距離＆NBSP; *使用edittag：引物進行整合序列標籤PCR引物我們提供了多種大型成套編輯指標序列標籤以下格式使用edittag設計的：＆NBSP; *文本 -...

VULCAN項目提供計算流體動力學分析。VULCAN（粘性迎風算法的複雜流量分析）提供了亞音速計算流體動力學通過高超聲速湍流反應和對各種串行和並行計算平台的非反應流。推進流分析的計算成本是通過使用特殊的紊流壁處理，多網格方法橢圓和空間推進計劃減小，並且方程的調理，以減少數值剛度。物理建模能力通過納入模型壓縮，雷諾應力各向異性，湍流擴散，有限率化學，湍流/化學反應相互作用效果的提高。VULCAN可以模擬二維，三維，或軸對稱多塊的問題 什麼在此版本中是新的： ...

seriesoftubes是一個擴展的管道的Solexa芯片起的數據。包文件 要求...

reciprocal_smallest_distance是使用全局序列比對和序列之間的最大似然進化距離準確地檢測基因組之間的同源基因成對直向算法。安裝從壓縮包下載並解壓最新版本github上：CD〜捲曲-L https://github.com/downloads/todddeluca/reciprocal_smallest_distance/reciprocal_smallest_distance-VERSION.tar.gz...

構建類似於make系統經常用於創建複雜的工作流程，如在生物信息學和NBSP; snakemake旨在通過提供一個乾淨的和現代的特定領域的規範語言（DSL）在python風格使創建工作流程的複雜性，以及快速，舒適的運行環境。安裝 - 在Ubuntu 12.04中，可以安裝Debian軟件包python3-snakemake可在我們啟動板庫。 - 在其他系統上，你需要的Python> = 3.2的安裝工作。根據您的系統，您可以通過發出任何的easy_install...

Geant4的項目是一個工具包，顆粒通過物質的通道的模擬。其應用領域包括高能物理和核實驗，醫療，加速器和空間物理學研究 什麼在此版本中是新的： 在使用貝爾蒂尼級聯伽瑪核互動的新模式加入。的貝爾蒂尼模型PI-，K-，以及用於在休息核捕獲的Sigma-被引入，隨著WentzelVI模型多次散射E...

在STEME項目開始生活作為一個近似的預期，Maximisation算法的圖案發現者，如MEME使用模型的類型。STEME大局; EM近似運行一個數量級比更迅速的MEME實施為典型的參數設置。 STEME現已發展成為在自己的權利一個不折不扣的圖案發現者。為什麼要使用STEME？成熟的模式發現技術STEME是基於嘗試和測試MEME算法。...

Genepidgin是一套Python的工具，協助評估和分配基因產品名稱及NBSP;有三個主要組成部分：genepidgin *清潔*＆NBSP;規範了每UNIPROT命名規則基因名稱genepidgin *比較*＆NBSP;比較兩個或更多組基因名稱的genepidgin *選擇*＆NBSP;從同源性證據vareity選擇最適當的產品名欲了解更多信息，包括當前的發展狀況，請訪問Genepidgin的文檔 要求： ...