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GenoSuite是proteogenomic分析，制定了一個框架。 FDRScore基於策略被用於集成來自多個搜索算法的結果。原核Proteogenomic工具（PPT）被開發作為GenoSuite框架的一部分。 PPT是尋找在原核基因組新穎的翻譯，並且依賴於質譜基於蛋白質組學數據和相關的基因組序列。功能包括配置為4開源的算法來執行數據庫搜索肽識別和4算法可以選擇任意組合，列出了基因組搜索特定的肽（肽小說），光譜匹配可以可視化的質量評估，列出了的新的蛋白質和變化在現有蛋白註釋，以及新穎肽的基因組的視覺上下文還可以生成
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