Open Babel

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Open Babel
軟件詳細信息:
版本: 2.3.2
上傳日期: 17 Feb 15
許可: 免費
人氣: 58

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打開通天塔是一個開源的,已被設計作為一種化學工具箱特別設計的以識別化學數據的眾多語言協作,自由和多平台庫軟件。它被簡單地稱為“開放化學工具箱”的。在一個glanceWith打開巴別特徵時,用戶將能夠搜索,分析,轉換,以及從化學,分子建模,生物化學,以及其他相關領域存儲數據。它支持多種常見的化學文件格式,包括MOL2,SDF / MOL,PDB,XYZ,SMILES,和CML。
此外,打開通天提供了一個全功能的程序員的工具包,化工MIME支持,SMARTS匹配,靈活的原子/債券打字員,氫刪除和添加,位向量類,矩陣,向量轉換,以及分子測試suite.Under引擎蓋和支持的操作系統systemsOpen巴貝爾在C ++語言編寫的。它&rsquo的;支持GNU / Linux的,BSD,的Solaris,SGI,微軟Windows和Mac OS X操作系統的SA真正的跨平台軟件。 32位和64位計算機是在寫作的時候this.Getting開始與所有開放BabelFirst正式支持,我們強烈建議您使用預編譯的二進制包,從默認的軟件倉庫安裝打開通天您Linux發行版。如果您的GNU / Linux系統沒有按&rsquo的;噸在其回購打開通天塔軟件,那麼你&rsquo的;將不得不編譯和安裝使用提供Softoware存檔中的普遍來源的應用程序。
將壓縮包下載(tar.gz壓縮),將其解壓縮到您選擇的位置,打開一個終端仿真器,定位到解壓的文件夾,並執行與ldquo; cmake的”的命令(不帶引號)配置項目。然後,你必須運行“讓”的命令,不包括引號,當然,編譯它。請確保在之前的上述指示安裝在您的操作系統的CMake的工具

什麼在此版本中是新的

  • 在這個版本是一個重大的錯誤修復釋放,應該是一個穩定的升級,強烈建議開啟通天塔的所有用戶。很多bug和改進已經在去年以來的2.3.0版本中增加的。

什麼是2.2.2版本,新的

  • 在這個版本是一個重大的錯誤修復釋放是一個穩定的升級,強烈建議開啟通天塔的所有用戶。雖然可能沒有很多新的功能,很多死機等錯誤已得到修復,因為2.2.1。
  • 在升級到新的InChI 1.02版本,生產標準化InChI和InChIKey輸出。
  • 在讀/寫時SMILES修正許多立體的錯誤。這是將在2.3版本中完成了一個更大的項目的一部分。
  • 在固定的編譯和安裝在Cygwin和MinGW平台。
  • 在顯著改善芳香和凱庫勒債券分配。
  • 在改進2D - >三維坐標生成
  • 在改進使用--gen3d命令行操作坐標生成
  • 在性能提升的坐標生成。
  • 新--fillUC的命令行操作巴貝爾。
  • 修正了pH依賴型加氫。
  • 新增支持從莫爾登,MOLPRO和NWChem讀取振動數據輸出文件。
  • 從最近的理論計算更新原子半徑。
  • 修正了當讀取gzip壓縮MOL2或XML文件。

  • 錯誤後
  • 在關閉文件。修復了Pybel一個錯誤的地方文件將照常開放。
  • 還有更多的bug修復和小功能改進。 ==新的文件格式==進出口:
  • 在MOLPRO輸入和輸出。
  • 在VASP協調文件(CONTCAR和POSCAR)。

什麼是2.2.1版本,新的

  • 在改進腳本接口,包括Python 3的支持和改進Java和C#的支持。
  • 在增加了對MACCS指紋支持。感謝RDKit項目。
  • 在許多修復和增強力場代碼。特別是UFF力場實現應該處理更多的分子。
  • 在改進的3D坐標生成,尤其是環片段。你可以給這與obgen工具一試。
  • 修正了各種PDB導入錯誤與原子類型。
  • 在增加了閱讀收費和半徑從PQR文件格式的支持。
  • 在增加了讀寫單元細胞PDB格式的支持。
  • 最新及QUOT;輸出"採取通用&QUOT文件格式; .OUT"," .LOG"和" .DAT"文件和讀取基於內容相應的文件類型。目前運作非常良好的量子化學包。
  • 新增改進的錯誤處理和報告當無法加載文件格式。
  • 在改進CIF文件格式的支持。
  • 在很多,很多,很多額外的bug修復和小的改進。

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