RAPTOR

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RAPTOR
軟件詳細信息:
版本: 4.5
上傳日期: 28 May 15
許可: 免費
人氣: 3043
尺寸: 559743 Kb

Rating: 3.6/5 (Total Votes: 5)

RAPTOR是專為精確蛋白質結構預測的創新軟件。它結合了先進的分析工具於一體的綜合軟件解決方案,並提供了三種不同的線程方法。 RAPTOR獨特整數規劃優化方法是最有效的用於查找的低序列同源性目標結構的模板,並且能夠產生高質量的模型。易於使用的界面和易於理解的Ë值非常適合初學者和專家。首先,直觀的顯示輸出使用戶能夠理解的結果只是一目了然。給定靶蛋白序列,如果存在具有已知三維結構的同源蛋白質,它可以通過使用序列搜索工具,如PSI-BLAST時,在RAPTOR還提供找到。目標的結構,然後從已知的結構建;然而,當序列同源性不顯著,即低於25%,PSI-BLAST不能拿出一個自信的打擊。不像PSI-BLAST,它只是做了搜索序列,蛋白質線程,折疊識別,利用兩者的同源性和結構的信息。它掃描具有未知結構與已知結構的數據庫中的蛋白質序列。通過使用計分函數,並進行三維結構和線性蛋白質序列之間的相容性的分析,最好​​的結構模板將被確定從中生成所述序列的結構。其結果是,蛋白質線程給出了一個優越的預測比同源建模時有邊際的序列同源性

限制

功能有限

支持的操作系統

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意見 RAPTOR

1 註釋
  • reza 23 Feb 21
    غیر از این نسخه 2015
    نسخه بروز تزی وجود نداره ؟
    و کار این نرم افزار چیه؟
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