Marvin

在馬文的項目提供了Java工具的集合繪製，顯示和描述的化學結構，下部結構和反應。
馬文可方便地安裝在桌面上，並無縫集成到通過其應用程序編程接口（API）的網頁和第三方應用程序。
馬文系列包括以下工具：
* MarvinSketch
* MarvinView
* MarvinSpace
* MolConverter

applet或bean？
馬文是根據使用兩種封裝可供選擇：
*馬文的小程序的Web開發人員
*馬文豆化學家的桌面和軟件開發。
馬文小程序是建立化學網頁的工具，這與大多數瀏覽器（IE瀏覽器，火狐，Safari，Opera等），他們提供從/ JavaScript的訪問，並通過定制applet參數兼容。
馬文豆類和整合能力，馬文到任何Java應用程序輕鬆地安裝應用程序的桌面工具

什麼在此版本中是新的：

• 在MarvinSketch：

在chemicalize.org
• 在公共數據庫搜索。
• 在可能改變配體順序MarvinSketch。
• 霧效果可以以各種方式進行控制：
• 有一個在素描/查看GUI首選項對話框設置的霧效果的強度和複選框以關閉自動霧效果的顯示選項卡上的滑塊。
• 在Applet和豆類參數介紹：fogFactor，automaticFogEnabled。 （論壇主題）。
• 在附加到一組連接點不會自動再取消組合Sgroup。
• 在S-基含量的測定：多和通用的S-組必須包含債券渡括號中的整個子圖
• 在S-組的內容更新，如果支架位置發生變化：無論是支架或結構移動
。
• 在S-組嵌入和重疊是在分子一致性檢查檢查。
• 在SMARTS的進口支持脂肪與碳雙鍵（論壇主題）。
• 在SMILES導入/導出支持聯烯。
• 在生成的傳統名內一個較大的複合片段（如＆QUOT;氫溴酸右美沙芬＆QUOT;）。
• 在支持CAS號碼轉換。
• 在DocumentExtractor（缺少逗號，括號誤識別的類型，多餘的空格，...）提高OCR糾錯。
• 在文件提取的PDF文檔現在給命中的頁碼。
• 在改進的結構到名稱和名稱到結構的通用名稱支持。對於名稱的進口普遍支持增加5％左右，共同和系統的名稱10％。轉換速度提高了20％左右。
• 在JChem和Marvin豆類安裝的Windows還提取shell腳本的cygwin的。
• 在保存在比米斯-Murcko框架exocycyclic組。
• 在鹵素燈可以枚舉過程中多個連接。
• 在芳香債券計算雙鍵的同源性檢查數量時考慮。
• 在套索選擇模式可設置為默認的MSketchPane（論壇主題）。
• 在一個新的功能，isChiral已添加到TopologyAnalyzer。
• 在新耐酸鹼條款功能：isQuery（），fieldAsString（）
。
• 在錯誤修正：
• 在名稱框中並非組創建之後進行更新，因為創建一個組並沒有增加圖形不變的變化計數（論壇主題）。
• 在MarvinSketch應用程序不了解＆QUOT; - {名}＆QUOT;命令行參數。
• 當結構＆gt;查找構建在線菜單下的Linux調用，無法被檢測到的默認瀏覽器中顯示的結果（論壇主題）。
• 如果其未壓縮的版本被存儲在高速緩存來自Java緩存isotopes.data文件的裝載失敗（即如果解壓縮是由網絡服務器自動地完成的，而不是通過馬文）。論壇主題，文檔。
• 在圖形對象並沒有顯示在幾何插件結果窗口。
• 在電子流向箭頭，藍色框突出被錯過了（論壇主題）。
• 如果定義被刪除的支架配體為了不顯示，即使＆QUOT;總是QUOT;顯示選項設置為＆QUOT;配體訂單＆QUOT;在首選項對話框。
• 在多中心原子的出口指數為MDL分子格式，如果它被連接到一個R-組之後，走向腐敗。
• 在箭堅持矩形期間MRV進口/出口（論壇主題）被損壞。
• 在1個字母肽導入失敗在一個單一的組氨酸（論壇主題）。
• 在隱氫被從SKC進口失踪。
• 在MolAtom的空屬性值沒有導出/在MRV格式的導入。
• 在通過導入某些SMARTS，錯鍵型確定的，而不是單一的或芳香的債券。
• 在從繪製的ChemDraw CDX文件導入某些括號中顯示了錯誤的方向。
• 在SMARTS出口：芳香環的1原子單鍵鄰居導出為單鍵，而不是單/芳
• 在與導出鏈接節點，R-組查詢的SMARTS的格式不正確。
• 的氫原子的處理是模棱兩可的SMARTS表達式。
• 在分子文件註釋字段導入失敗。
• 在某些SMILES的導入是錯誤的（論壇主題）。
• 如果該模板包含一個鏈部可以位於目標作為環（或環系統）的一部分，我們應該忽略的模板的一部分。
• 在精細與Hydrogenize選項Clean3D並沒有自動取消組合S-組（論壇主題）。
• 在Molecule.contractSgroups（）搞砸分子坐標（論壇主題）。
• 在明確氫還沒有適當考慮順/立體化學計算。
• 在互變異構體生成器拋出ArrayIndexOutOfBoundsException異常在某些情況下。
• 在枚舉的同源性產生不一致分子對一些VMN輸入。
• 在不正確的充電應用CovalentCounterion定影液後計數。
• 在StructureChecker命令行的日誌輸出格式從嚮導的輸出格式不同。
• 在ChiralFlagErrorChecker沒有正確處理手。而不是從奇偶校驗數據計算手性，它採用一種實現基於TopologyAnalyser的isChiral方法。

什麼是新的在電子流箭版本5.4.0.1:

• Highlighting是錯誤的基地時，或終點是債券（論壇主題）。
• 在序列化菜單配置沒有工作。
• 在多中心原子的索引被錯誤地在MDL MOLFile出口情況下R-組連接到多中心原子（位置變化債券）結構的創建。
• 在隱氫從結構ISIS /素描的Symyx文件格式（SKC文件格式）的導入或粘貼後的原子
失踪。
• 在CDX文件，包括從舊版本的的ChemDraw出口旋轉圖形對象無法導入。
• 在互變異構體計算
• 通用​​互變異構體不是在某些情況下，足夠獨特。由於修復，一般互變異構體提供芳香形式。
• 在Canoncical互變異構體的計算已因脫芳烴的修復改善。

與楔形鍵連接明確氫
• 在某些結構中通用的互變異構了一個例外。
• 在成交量計算是缺少cxcalc。
• 在結構檢查拋出而不是忽略不正確的配置文件NullPointerException異常。

什麼是新的版本5.1.03.2:

• IUPAC名稱導入：轉換IUPAC名稱的結構。
• 在OLE 2支持：粘貼MarvinSketch對象到MS Office文檔的改進支持
• 在化工條款：可從馬文在命令行，API，可以在Java的腳本中使用（在小程序）
• 在加速MarvinSketch和MarvinView初始化啟動時，無論是作為獨立版本，並在其他應用程序中實現組件。

要求：

• 在Java 2標準版運行環境