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的系統生物學標記語言（SBML）是基於XML的描述語言表示計算模型在系統生物學和生物信息學。KEGG2SBML的功能目前僅限於只轉換KEGG代謝途徑的文件，而不是其他類型的KEGG文件。KEGG2SBML可以轉換KEGG通路數據庫版本46.0或更高版本。 （過去KEGG通路數據庫的版本都沒有經過測試，可能不會被KEGG2SBML進行轉換。）它可以產生SBML Level 1和Level 2（第1版），有或沒有不標註使用CellDesigner和SBML 2級版本2級和2級第3版的註解。 ...

Topographica是一個軟件包，用於神經地圖的計算模型。目的是幫助科學家理解大腦功能的組成感覺和運動系統地形圖的水平。Topographica旨在補充了許多很好的低級別的神經元模擬器可用，如創世紀和神經元。這些模擬器專注於模擬神經元，其中小型網絡的詳細內部行為。Topographica代替集中於大型的結構和功能是可見只有當成千上萬這樣的神經元被連接到含有百萬連接地形圖。許多重要的現象無法加以研究沒有這種大的網絡，包括兩維視覺方向和運動方向的地圖，和對象分割和分組處理的組織。為了使這樣的模型實用，在To...

圖是連接頂點對數學對象，包括頂點和邊：認為城市為頂點和州際公路的邊緣連接兩個城市。算法可能發現的最短路徑 - 最快的路線 - 或者最小生成樹或解決在圖形上其他有趣的問題之一：最大流量，權重和非權重匹配和最小費用流。可視化裝置連接的原因 - 一種算法的發言 - 立即的效果 - 變化的曲線，該算法具有作為其輸入 -...

阿帕奇哈馬是一個工具包使用的介質，其中需要大量的數據進行分析和處理。哈馬專門針對科學介質中，能夠還解釋和執行基本或更高級的數學運算，同時，也從多個集群（基於雲基礎設施）起作用。這主要是由於它的BSP（散裝同步並行）的功能，能夠從矩陣為基礎的數據處理任何，基於網絡的計算等許多更多。至於它的結構哈馬是由三部分組成：外殼，哈馬核心，一個公共的API。這些工具可以用來與系統無論是在實時或預定任務交互 是什麼在此版本中是新的： 修正/改善DoubleVector和DenseDoubleVector...

Artoo開發人員可以通過Ruby代碼控制機器人和各種硬件設備。這基本上使開發人員能夠放下複雜的機器代碼，並使用Ruby來代替。Artoo不僅與紅寶石的作品，而且還與的JRuby 和 Rubinius的作為良好。該混合動力集團也提供了類似的機器人框架：JavaScript的（Cylon.js）去（Gobot）下面是來自洛杉磯的Ruby會議2013視頻演示Artoo的。 功能： 支持的驅動程序，硬件及平台： Ardrone 的Arduino BeagleBone Crazyflie ...

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它提供了類和函數與系統發生數據，如樹木和字符矩陣工作。它還支持讀取和寫入數據的範圍為標準系統發生的數據格式，如NEXUS，NeXML，PHYLIP，的Newick，FASTA等。此外，用於執行一些有用的進化計算腳本分佈為庫，如SumTrees，其概括了用於通過系統發生樹的後部樣品給定分裂或分支的支持的一部分。有擴展文檔和教程文件在下載包 什麼是此版本的新： 在新的元數據基礎設施註釋：AnnotationSet和註釋完全支持NeXML 0.9元數據分析和編寫。...

big.js 是一個精簡版的 bignumber.js ，以較小的方法和較輕的項目，更小的尺寸。就像當初，圖書館純屬提高JavaScript的內置數學函數與BigDecimal的Java類的功能。開發人員應該能夠使用big.js無需任何外部的依賴或不具有頁上裝載的笨重JavaScript框架。該庫可工作在客戶端（瀏覽器）和服務器端（Node.js的）環境。文檔也包括在內，讓開發商開始對自己的項目。 是什麼在此版本中是新的： 在加多個構造函數的功能。 什麼在3.0.1版本新： ...

BioRuby提供了生物信息學的集成環境（生物信息學）。面向對象的腳本語言Ruby有許多功能，適用於生物信息學研究，例如，清楚的語法來表達複雜的對象，對於文本處理正則表達式一樣強大的Perl的大局;，各種各樣的圖書館，包括Web服務等。由於Ruby的語法很簡單，很乾淨，我們認為這是簡單易學，適合初學者，易於使用的生物學家，也是足夠強大的軟件開發人員。在BioRuby，開發人員可以檢索平面文件，互聯網Web服務器和本地關係型數據庫的生物資料庫的條目。這些數據庫條目可以被解析以提取所需的信息。生物序列可以用紅寶...

Gobot允許開發人員編寫，它通過谷歌的開始語言控制物理硬件的應用程序。Gobot支持通用I / O驅動程序和幾個主要的硬件平台以及。這使編程人員開始編寫自己的代碼並運行它不會對各種設備和硬件的任何問題。它基本上使指揮機器人非常簡單，無需編寫複雜的機器級代碼，但只能通過圍棋。由於機器人和物理計算可能本身就是一個複雜的任務，一定要對你未來去為動力的機器人在開始工作前請仔細閱讀Gobot文檔。該混合動力集團也提供了類似的機器人框架：紅寶石（Artoo）JavaScript的（Cylon.js） ...