GMOD

GMOD 1.69

GMOD是通用模式生物數據庫項目,開源軟件工具,用於創建和管理基因組範圍內的生物數據庫集合。這樣的數據庫包含的基因組和生物實驗室生物學信息。它可以用來創建基因組註釋的小型實驗室數據庫,或一個較大的web可訪問社區數據庫。這個應用程序是用Java,C...

KEGG2SBML

KEGG2SBML 1.5.0

的系統生物學標記語言(SBML)是基於XML的描述語言表示計算模型在系統生物學和生物信息學。KEGG2SBML的功能目前僅限於只轉換KEGG代謝途徑的文件,而不是其他類型的KEGG文件。KEGG2SBML可以轉換KEGG通路數據庫版本46.0或更高版本。 (過去KEGG通路數據庫的版本都沒有經過測試,可能不會被KEGG2SBML進行轉換。)它可以產生SBML Level 1和Level 2(第1版),有或沒有不標註使用CellDesigner和SBML 2級版本2級和2級第3版的註解。 ...

Topographica

Topographica 0.9.7a

Topographica是一個軟件包,用於神經地圖的計算模型。目的是幫助科學家理解大腦功能的組成感覺和運動系統地形圖的水平。Topographica旨在補充了許多很好的低級別的神經元模擬器可用,如創世紀和神經元。這些模擬器專注於模擬神經元,其中小型網絡的詳細內部行為。Topographica代替集中於大型的結構和功能是可見只有當成千上萬這樣的神經元被連接到含有百萬連接地形圖。許多重要的現象無法加以研究沒有這種大的網絡,包括兩維視覺方向和運動方向的地圖,和對象分割和分組處理的組織。為了使這樣的模型實用,在To...

Gato

Gato 1.1.2

圖是連接頂點對數學對象,包括頂點和邊:認為城市為頂點和州際公路的邊緣連接兩個城市。算法可能發現的最短路徑 - 最快的路線 - 或者最小生成樹或解決在圖形上其他有趣的問題之一:最大流量,權重和非權重匹配和最小費用流。可視化裝置連接的原因 - 一種算法的發言 - 立即的效果 - 變化的曲線,該算法具有作為其輸入 -...

Finance.js是做,而不是發送數據給服務器,並等待響應所有的在客戶端金融計算的,一個非常有用的庫。它可以處理大量的操作,從簡單的數學加法到更複雜的攤還。圖書館自動化的各種財務計算,並讓開發商指定簡單的參數,並得到各知名金融公式,費率和時間表的結果。示例和使用說明都包含在Finance.js下載包 功能: 在可自動格式化數字字符串可自動格式化字符串貨幣可自動格式化百分比能處理的貨幣指標可以計算:在貸款支付金額資助金額資助幾個月利率應計利息分期付款計劃 要求: ...

jQuery的結合可以讓開發人員在JavaScript對象執行像工會,交,差和對稱差操作。這意味著複雜的JavaScript陣列可以添加或相交為使用在高級數學計算。【舉例和使用說明都包含在下載包 要求: 在客戶端中啟用JavaScript...

BioRuby

BioRuby 1.5.0 更新

BioRuby提供了生物信息學的集成環境(生物信息學)。面向對象的腳本語言Ruby有許多功能,適用於生物信息學研究,例如,清楚的語法來表達複雜的對象,對於文本處理正則表達式一樣強大的Perl的大局;,各種各樣的圖書館,包括Web服務等。由於Ruby的語法很簡單,很乾淨,我們認為這是簡單易學,適合初學者,易於使用的生物學家,也是足夠強大的軟件開發人員。在BioRuby,開發人員可以檢索平面文件,互聯網Web服務器和本地關係型數據庫的生物資料庫的條目。這些數據庫條目可以被解析以提取所需的信息。生物序列可以用紅寶...