Staden Package

軟件截圖:
Staden Package
軟件詳細信息:
版本: 1.7.0 / 2.0.0 Beta 8
上傳日期: 12 May 15
許可: 免費
人氣: 8

Rating: 2.0/5 (Total Votes: 1)

施塔登包是一個全面發展的一套DNA序列組裝(Gap4),編輯和分析工具(旋轉)為Unix,Linux和MacOSX上和MS Windows的。
在Gap4面前出現了幾次小的加入相關
改進如何得分加盟查找內部聯接和
在加入編輯器中的對齊按鈕的功能。
還後果gap4的是各種變化io_lib(該
庫所有I / O,以各種跟踪文件格式)。通過加入
新hash_exp程序現在允許實驗文件是
連接到一起,並建立索引。實驗的文件名列表
應STIL提供給gap4,但所提供的EXP_PATH環境
變量已經被正確設置gap4就能取個人
序列出級聯實驗文件
存檔。改進的用戶界面,這仍然需要
製作。
454 SFF檔案現在更好的支持。該defsult 454指數
現在的工作,雖然hash_sff程序可以被用來提供一個
另一種索引策略(可能快於某些情況下)。
Gap4和崔佛也有另外的痕跡跟踪顯示風格,
每次有電話基地1個樣品掃描(4個通道)。在這種情況下,可以
也借鑒4置信度值,而不是1元的基礎。這些能力
將能更好地整合的Solexa的痕跡時,更容易
可用。
另外,當然bug修復和小的調整通常的組合。見
完全更改日誌詳細信息(通過SourceForge的網站)。
其他顯著的變化
Gap4

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