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mpiBLAST是一個基於MPI並行實現NCBI BLAST的。該項目包括的一對替代FORMATDB和blastall與執行BLAST作業並行安裝了MPI的計算機集群上的版本方案。有兩個主要的優勢，使用mpiBLAST與傳統的BLAST。
首先，mpiBLAST分割在每個節點的數據庫集群中。因為數據庫的每個節點的段是較小它通常可以駐留在緩衝區緩存，得到顯著加速由於消除的磁盤I / O。其次，它允許BLAST用戶採取有效的，低成本的Beowulf集群的優點，因為處理器間通信的要求是低的。
mpiBLAST實現在情況下數據庫是太大，無法放入RAM超線性加速，並在附近的其他情況下的線性加速。它不需要專用群集。
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