misopy

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misopy
軟件詳細信息:
版本: 0.4.9
上傳日期: 20 Feb 15
開發: Yarden Katz
許可: 免費
人氣: 7

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

MISO(異構體的混合物)是用Python編寫的概率框架,進行定量的表達水平與NBSP;從RNA測序數據的選擇性剪接基因,並確定整個樣本差異調節亞型或外顯子。
通過模擬的生成過程,其中讀取來自於RNA測序亞型的生產,從MISO模型使用貝葉斯推斷來計算該讀出來自一個特定同種型的概率。
MISO使用的讀操作亞型定量底層一套替代mRNA異構體的豐度的推斷分配。置信區間過度估計可以得到的,其量化所述估計值的可靠性。
請參閱http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/的MISO手動和文檔

要求

  • 在Python中

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